Родился 24 апреля в 1940 году в городе Могилев (Белоруссия). В семью Нигинских эвакуировали город Орск Оренбургской области, когда Евгению не было двух лет. Четыре года семья жила в землянке, потом в бараке.
После школы поступил на факультет педиатрии Свердловского медицинского института на специальность «врач-невролог», который окончил в 1964 году. Места в общежитии не дали, поэтому будущий врач снимал квартиру. Платил хозяевам тем, что обучал их ребенка, который отставал в развитии.
После получения диплома молодого специалиста направляли в Алжир. Для этого Евгений выучил французский язык. В назначенный день Нигинский получил распределение в Лабытнанги. Три года работал детским врачом. Затем четырнадцать лет лечил детей в Салехарде, потом стал врачом окружной больницы.
«Человечность. Самое главное, чтобы медицинский работник любил людей! Остальному можно научить» – Е. М. Нигинский.
В 1981 году руководство Главтюменьгеологии во главе с Фарманом Салмановым решило создать в Тюмени ведомственное лечебное учреждение для обслуживания геологов. На должность главного врача пригласили Евгения Моисеевича, который в это время возглавлял систему здравоохранения Ямало-Ненецкого автономного округа.
Создание поликлиники началось со строительства здания и подбора кадров. Тогда Нигинский говорил: «У нас будут работать самые квалифицированные и душевные врачи». Он заложил прочный и, как показало время, самый надежный фундамент в концепцию развития медицинского учреждения: строгий отбор кадров, оснащение передовым оборудованием, внедрение новейших методов диагностики и лечения.
Евгений Моисеевич знал по имени и отчеству не только коллег-врачей, но и санитарок.
Нигинский руководил поликлиникой двадцать лет. С 2003 года учреждение носит имя заслуженного врача РСФРС, Отличника здравоохранения России, лауреата премии им. Ю. Н. Семовских Евгения Моисеевича Нигинского. В память о нем на фасаде здания установлена мемориальная доска.
